Тоді люди задумали просити в нього вибачення, але 30-літній Макарій, довідавшись про це, втік у Скитську пустелю в Єгипті. 340 року його було висвячено на священика. Життя Макарія було дуже суворим, а їв він тільки раз на тиждень. Він повчав своїх учнів: "Упродовж останніх 20 літ я ніколи не їв, не пив і не спав стільки, скільки потребувало моє тіло". До Господа Макарій відійшов у 390 році, проживши 60 літ у пустелі, де він був духовним батьком багатьох святих пустельників.